ÉTUDES DE LA CONFORMATION DE PENTAPEPTIDES CYCLIQUES PAR LA RÉSONANCE MAGNÉTIQUE NUCLÉAIREReport as inadecuate




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Résumé : L-étude des propriétés du peptide bicyclique S, S-bis-cyclo-glycyl-L-hemicystyl-glycyl- glycyl-L-prolyl vis-à-vis du transport actif des ions alcalins à travers une membrane nous a conduits à examiner par la spectroscopie RMN différents pentapeptides cycliques tels que ceux décrits dans la première figure 1, 2. Tous les composés examinés se caractérisent par la présence dans la position 5 d-une proline, soit sous sa forme L, soit sous sa forme D. Les spectres RMN dans le DMSO montrent très clairement l-existence à température ambiante de deux conformations stables en équilibre, qui trouvent leur origine dans l-isomérie cis-trans de la liaison peptidique entre le résidu 4 et la proline 5. Nous nous sommes donc attachés à décrire géométriquement les deux conformères ainsi que leurs populations relatives en fonction de la température et du solvant utilisé 3, 4, 5. Pour garantir l-univocité de l-identification des différentes glycines, nous avons procédé à la deutériation, premièrement de la glycine 1 et deuxièmement des deux glycines 1 et 4 Fig. 1. La spectroscopie RMN permet, par l-étude des constantes de couplage J NH-CH, la détermination des angles φ d-un peptide 6. La variation du déplacement chimique des protons amides en fonction de la température décrit le comportement de ceux-ci vis-à-vis du solvant. Dans certains cas ces mesures peuvent mettre en évidence la présence de ponts hydrogènes intra 7, 8. Une description détaillée de la conformation du « backbone » d-un peptide exige également la connaissance des angles ψ et ω. C-est pourquoi nous avons complété nos mesures expérimentales par la détermination théorique sur ordinateur de la carte énergétique de chaque conformère en fonction des angles de rotation ψ et ω où les minima d-énergie désignent les conformations cherchées.





Author: J. Meraldi H. Moeschler R. Schwyzer A. Tun-Kyi K. Wuthrich

Source: https://hal.archives-ouvertes.fr/



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