Validación de tilling en evaluación de progenies endocriadas de yuca irradiada (manihot esculenta crantz) Report as inadecuate




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En el marco de la creciente tendencia a la agroindustrialización de la yuca, y dado que las características del almidón definen el potencial industrial de estas raíces, aquellas herramientas moleculares que permitan identificar variantes de interés deben integrarse a programas de mejoramiento genético para seleccionar eficientemente nuevos materiales parentales. En este trabajo se compararon los resultados de la técnica TILLING de genética reversa modificada en cuanto a la visualización directa de los productos de digestión en gel de agarosa, con el método tradicional que utiliza gel de acrilamida y plataforma Li-Cor. La comparación se llevó a cabo a través de la evaluación de polimorfismo en 10 genes con control metabólico mayor de la ruta del almidón. En 150 líneas endocriadas M2, derivadas de semillas irradiadas, fueron identificadas fenotípicamente como probables mutantes y analizadas por TILLING. Solo 30% de los cebadores utilizados produjo datos de buena calidad pues la mayoría amplificó más de un blanco. Adicionalmente, la detección visual de SNP en agarosa no corresponde con los registros obtenidos a partir del genotipado por Li-Cor, pues con ella no se logró detección de SNP, ni en plantillas de mezclas de ADN, ni en muestras individuales.

Tipo de documento: Artículo - Article

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Palabras clave: síntesis de cebadores, polimorfismo en nucleótidos individuales SNP, genética reversa, mutación inducida, calidad de almidón, plataformas de genotipado.





Source: http://www.bdigital.unal.edu.co


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Validación de TILLING en evaluación de progenies endocriadas de yuca irradiada (Manihot esculenta Crantz) Validation of TILLING in the evaluation of inbred progenies of irradiated cassava (Manihot esculenta Crantz) Adriana Tofiño1, 6, Diana Cabal2, Hernán Ceballos3, Juan Carlos Pérez4 y Hernán Mauricio Romero5 RESUMEN ABSTRACT En el marco de la creciente tendencia a la agroindustrialización de la yuca, y dado que las características del almidón definen el potencial industrial de estas raíces, aquellas herramientas moleculares que permitan identificar variantes de interés deben integrarse a programas de mejoramiento genético para seleccionar eficientemente nuevos materiales parentales.
En este trabajo se compararon los resultados de la técnica TILLING de genética reversa (modificada en cuanto a la visualización directa de los productos de digestión en gel de agarosa), con el método tradicional que utiliza gel de acrilamida y plataforma Li-Cor.
La comparación se llevó a cabo a través de la evaluación de polimorfismo en 10 genes con control metabólico mayor de la ruta del almidón.
En 150 líneas endocriadas M2, derivadas de semillas irradiadas, fueron identificadas fenotípicamente como probables mutantes y analizadas por TILLING.
Solo 30% de los cebadores utilizados produjo datos de buena calidad pues la mayoría amplificó más de un blanco.
Adicionalmente, la detección visual de SNP en agarosa no corresponde con los registros obtenidos a partir del genotipado por Li-Cor, pues con ella no se logró detección de SNP, ni en plantillas de mezclas de ADN, ni en muestras individuales. In the context set by the continuously growing agroindustrialization of cassava, and given that starch traits define tuber industrial potential, molecular tools that allow identifying variants of interest should be integrated into breeding programs for efficient selection of parental materials.
The present research study compared the TILLING reverse genetics tech...






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