Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-pcr para la tipificación de klebsiella pneumoniae Report as inadecuate




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Para la tipificación de K. pneumoniae se evaluaron los resultados de tres variantes de la técnica de amplificación de secuencias repetidas rep-PCR comparándolos con los resultados de la tipificación con electroforesis en gel de campos pulsados PFGE. Se analizaron dos poblaciones de K. pneumoniae: una constituida por aislamientos causantes de infección nosocomial, recolectados durante un año en un hospital de tercer nivel y otra asociada a un brote intrahospitalario en una unidad de cuidado intensivo neonatal. La tipificación por PFGE se realizó con macrofragmentos obtenidos con Xbal. La rep-PCR se realizó con tres conjuntos de iniciadores correspondientes a las secuencias, BOX, ERIC y REP. Todos los aislamientos fueron tipificables por los tres sistemas rep-PCR y fueron discriminados de manera similar a lo obtenido con PFGE D = 0.978. El buen poder discriminatorio D = 0.974 obtenido con los procedimientos rep-PCR estandarizados permite sugerir el empleo de REP-PCR y BOX-PCR para tipificación rápida de aislamientos de K. pneumoniae, aplicada a estudios de epidemiología molecular de la infección nosocomial., The results of three variations of the repeated sequence rep-PCR amplification technique for typing K. pneumoniae were evaluated by comparing them with the results of pulsed field gel electrophoresis PFGE typing. Two K. pneumoniae populations were analysed; one was constituted by isolates causing nosocomial infection, collected throughout a year from a third-level hospital and the other was associated with an intra-hospital outbreak in a neonatal intensive-care unit. PFGE typing was done with macro-fragments obtained with XbaI. Rep-PCR was done with three sets of primers corresponding to BOX, ERIC and REP sequences. All isolates were typable by all three rep-PCR systems and were discriminated similarly to results obtained with PFGE D = 0.978. The good discriminatory power D = 0.974 obtained with standardised rep-PCR procedures leads to the suggestion that using REP-PCR and BOX-PCR for rapid typing of K. pneumoniae isolates can be applied to molecular epidemiology studies of nosocomial infection.

Tipo de documento: Artículo - Article

Información adicional: Departamento de Farmacia-Facultad de Ciencias Universidad Nacional de Colombia Se autoriza la fotocopia de articulos y textos para fines de uso académico o interno de las instituciones citando la fuente. Las ideas emitidas por los autores son reponsabilidad expresa de estos y no de la revista.

Palabras clave: Klebsiella pneumoniae, PFGE, rep-PCR, genotyping, Klebsiella pneumoniae, PFGE, rep-PCR, genotipificación.





Source: http://www.bdigital.unal.edu.co







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