Classes empiétantes dans un graphe et application aux interactions entre protéinesReport as inadecuate




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1 CERMSEM - CEntre de Recherche en Mathématiques, Statistique et Économie Mathématique 2 ENST Paris - Ecole Nationale Supérieure des Télécommmunications Paris 3 IML - Institut de mathématiques de Luminy

Résumé : Dans cet article, on étudie une méthode de classification reposant sur une recherche de zones denses en arêtes dans un graphe non pondéré. On ne cherche pas à faire un partitionnement mais à extraire des classes intrinsèques aux données, qui pourront donc être empiétantes. La méthode proposée est ensuite appliquée à un graphe d-interactions entre protéines, les classes mises en évidence pouvant permettre aux biologistes de prédire les fonctions cellulaires de certaines protéines.

Mots-clés : Bio-informatique classification graphe d-interactions





Author: Lucile Denoeud - Irène Charon - Alain Guénoche - Olivier Hudry -

Source: https://hal.archives-ouvertes.fr/



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