Treillis de concepts et ontologies pour interroger lannuaire de sources de données biologiques BioRegistryReport as inadecuate




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1 ORPAILLEUR - Knowledge representation, reasonning INRIA Lorraine, LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications

Résumé : Les sources de données biologiques disponibles sur le Web aujourd-hui sont multiples et hétérogènes. L-utilisation optimale de ces ressources nécessite de la part des utilisateurs des compétences à la fois en informatique et en biologie, à cause du manque de documentation et des difficultés d-interaction avec les sources de données. De fait, les contenus de ces sources de données restent souvent sous-exploités. Nous présentons ici une approche qui s-appuie sur l-analyse de concepts formels, pour organiser et rechercher des sources de données biologiques pertinentes pour satisfaire une requête donnée. Le travail consiste à construire un treillis de concepts à partir des méta-données associées aux sources. Le concept construit à partir d-une requête donnée est alors classifié dans le treillis. La réponse à la requête est ensuite fournie par l-extraction des sources de données appartenant aux extensions des concepts subsumant le concept requête dans le treillis. Les sources ainsi retournées peuvent être triées selon l-ordre de spécificité des concepts dans le treillis. Une procédure de raffinement de requête, s-appuyant sur des ontologies de domaines, permet d-améliorer le rappel par généralisation ou par spécialisation

keyword : metadata bioinformatics concept lattices ontologies data sources





Author: Nizar Messai - Marie-Dominique Devignes - Amedeo Napoli - Malika Smaïl-Tabbone -

Source: https://hal.archives-ouvertes.fr/



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